Ivan Begtin
9.16K subscribers
2.68K photos
5 videos
115 files
5.51K links
I write about Open Data, Data Engineering, Government, Privacy, Digital Preservation and etc.

CTO&Founder of Dateno https://dateno.io

Telegram @ibegtin
Facebook - https://facebook.com/ibegtin
Email ivan@begtin.tech

Ads/promotion agent: @k0shk
Download Telegram
Я об этом мало рассказывал, но в течение многих лет работа с данными, особенно их систематизация были моими хобби, а не работой. Я много лет занимался вначале разработкой ПО, потом архитектурой и управлением проектами, а параллельно сводил какие-нибудь таблицы для себя потому что "очень хотелось сводить таблицы" (с). Одно из таких моих увлечений ещё давно была систематизация международных организаций, институтов развития, банков развития и другие систематизации объединяющие группы стран и международные взаимоотношения.

У меня и сейчас есть их реестр, я его давно ещё вёл в Excel, потом перенес в Airtable и до сих пор регулярно им пользуюсь, например, когда ищу данные по тематикам, часто они есть на сайтах межгосударственных организаций. Там база межгосударственных объединений, блоков стран, таможенных и экономических союзов и банков развития. Такое полезное оказалось хобби, сильно помогшее мне в будущих задачах по data discovery.

А недавно я обнаружил что в Пекинском университете ведут похожую базу данных Public Development Banks and Development Financing Institutions Database [1], но только по банкам развития.

Любопытный проект, пересекающийся с моей базой где-то на 50-60%, но с визуализацией наглядно.

И да, их данные общедоступны, но для выгрузки требуют регистрацию [2].

Ссылки:
[1] http://www.dfidatabase.pku.edu.cn/index.htm
[2] http://www.dfidatabase.pku.edu.cn/DataDownloading/index.htm

#opendata #data #finances #china #banking
👍16🔥4
Немногие за пределами Китая знают о масштабах публикации там научных данных. При этом данных там много и, помимо таких проектов как SciDB и Findata существуют десятки крупных научных репозиториев с данными.

В большинстве из них в их основе лежит ПО InstDB [1] установленное в 72 научных учреждениях и служащее для раскрытия научных данных в режимах: открытости, доступа по авторизации и доступа по запросу.

Например, на InstDB работает центр научных данных академии наук Китая [2], репозиторий Института физики [3] и многих других научных организаций.

В Китае научных данных многократно больше чем на государственных порталах данных, которые тоже есть и которые, тоже, работают на типовом ПО. Но типовом местном ПО, разработанном китайскими компаниями. Это большая и важная страновая особенность по доступности данных. Ещё одна особенность в том что про китайские открытые данные почти не пишут в обзорах OKF или State of data. Это делает эти данные почти невидимыми для тех кто не знает о том как всё устроено.

А типовое ПО в виде InstDB позволило китайской академии наук создать поисковик Findata о котором я ранее писал.

Ссылки:
[1] https://market.csdb.cn/InstDB
[2] http://instdb.casdc.cn
[3] http://instdb.iphy.ac.cn

#opendata #china #datacatalogs #datasets
9👍6
К вопросу о качестве индексов в больших агрегаторов данных, приведу в пример SciDB [1] китайский агрегатор и портал для раскрытия научных данных. Всего там 8,7 миллионов объектов, можно было бы называть их датасетами, но датасеты там далеко не всё.

Когда смотришь подробнее на статистику то оказывается что в фильтрах гораздо меньше данных. В фильтре по годам 3.5 миллионов записей, в фильтре по типу около 5 миллионов записей из которых 4.25 - это "Other data",а по фильтру тематик вообще размечено только 50 тысяч наборов данных.

И тут просто таки начинаешь задаваться вопросом, а где же всё остальное? Неужели где-то врут?

Но, скорее всего не врут, а не договаривают. Общий индекс может быть большим, но данные там не родные, а импортированные из DataCite или Zenodo и других ресурсов. Они почти наверняка не размечены и не сматчены с тематиками SciDB и всем остальным. Похожая ситуация и в базе поиска Datacite и в OpenAIRE когда большая часть фильтров не фильтрует потому что нужно много работать над этим. Качество метаданных и качество поисковых индексов очень невысокое. Увы( Но это можно рассматривать не как проблему, а как вызов.

В Dateno тематическая классификация датасетов сейчас решается через классифицированные источники и через авторазметку по простым правилам, а в планах добавить разметку по расширенному классификатору и это даст возможность находить самые неожиданные данные.

Ссылки:
[1] https://www.scidb.cn

#opendata #datasets #datasearch #china
2👍1
В рубрике как это устроено у них японский национальный репозиторий результатов научных работ IRDB [1], включает 4.1 миллиона ресурсов, большая часть которых это научные статьи, журналы, публикации после конференций и так далее, а также боле чем 124 тысячи наборов исследовательских данных. Чем то IRDB схож с проектами OpenAIRE и SciDB, хотя и сделан весьма консервативнее.

В его основе харвестинг метаданных из более чем 700 научных репозиториев [2] в которых реализовано раскрытие метаданных по стандарту JPCOAR [3] через интерфейсы OAI-PMH. Сам репозиторий IDRB также поддерживает доступ через OAI-PMH [4] и с ним можно взаимодействовать программным образом.

Простота харвестинга во многом обеспечена тем что значительная часть репозиториев - это репозитории на базе open-source ПО Weko3 которое является доработанной версией репозитория для научных публикаций Invenio 3 и который и обеспечивает предоставление метаданных через OAI и, также, предоставляет иные, API упрощающие сбор данных. Weko3 был разработан Национальным институтом информатики Японии, той же организацией что управляет IRDB

У IRDB множество недостатков тоже есть:
- нет bulk download, нельзя скачать базу целиком
- нет документированного API, даже интерфейс OAI не упомянут на сайте, не говоря уже о том что он устарел для большей части задач
- схемы данных описания датасетов весьма консервативны. Нет даже разметки schema.org, не говоря уже о DCAT.

В целом проект выглядит проработанным, живым, но замершим в развитии.

Кстати, китайский проект SciDb сделан очень похожим образом. Также есть ПО институциональных репозиториев созданный структурой Китайской академии наук и централизованный архив/поиск индексирующий все эти репозитории.

Возвращаясь к IRDB, например, для Dateno проще автоматизировать сбор метаданных из японских репозиториев напрямую чем индексировать IRDB именно из-за отсутствия другого API кроме OAI.


Ссылки:
[1] https://irdb.nii.ac.jp
[2] https://irdb.nii.ac.jp/en/repositorylist
[3] https://schema.irdb.nii.ac.jp/en
[4] https://irdb.nii.ac.jp/oai

#opendata #data #openaccess #japan #china #openscience
2👍2
Я совсем пропустил публикацию обновлённого China Open Data Index [1] в январе 2024 года, а там интересные цифры в виде 345 853 наборов данных доступных на региональных государственных порталах открытых данных Китая.

А также всего с 2017 года появилось 226 городских порталов открытых данных (60% от всех городов) и 22 региональных портала из 27 провинций.

Точный объём данных на городских порталах неизвестен, но весьма велик почти наверняка.

Много ли это? Да много. Например, в США на портале data.gov опубликовано порядка 300+ тысяч наборов данных из которых от 60 до 80% - это открытые научные данные

А в Китае очень много научных данных доступно через scidb.cn и findata.cn.

Ссылки:
[1] http://ifopendata.fudan.edu.cn

#opendata #china #data
👍7🔥521
Один из крупнейших проектов с большими научными данными - это Китайский национальный центр биоинформации через сайт которого доступно более 53 Петабайт геномных данных [1]. Причём в августе 2021 года их было всего 5 Петабайт и сейчас можно наблюдать 10-кратный рост за 3 года. Такими темпами к концу 2025 года будут все 100 Пб.

Внутри центра много разных баз данных и архивов, от нескольких терабайт, до десятка петабайт. Все данные доступны в форматах специфичных в для биоинформатики и геномных исследований.

Часть этих данных полностью открытые и их можно сразу скачать через FTP или HTTP интерфейсы, часть требуют процедуры получения доступа через профильный комитет доступа к данным Data Access Committee(DAC) [2].

Ссылки:
[1] https://www.cncb.ac.cn/services
[2] https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/browse/HRA002875

#opendata #china #data #genomics #bigdata
👍53
Кстати, помните я расхваливал китайский портал/агрегатор научных данных SciDb [1].

Так вот его можно не только хвалить. После некоторого исследования его содержания он на 100% соответствует подходу "главное не быть, а казаться". Из заявленных 10 миллионов наборов данных лишь 18 тысяч имеют присоединённые файлы и загружены через сам портал, ещё 754 тысячи собраны из нескольких больших открытых порталов научных данных таких как Zenodo и PANGAEA, а всё остальное - это просто слепок поискового индекса по данным DataCite, сильно замусоренного и, объективно, без значимых метаданных, да и не факт что ссылки на сами данные.

С одной стороны, как обидно, так мало данных. С другой стороны, очередное подтверждение приоритетов индексирования и то что из SciDB можно собирать только те данные что туда были загружены. Другой вопрос что отфильтровать их непросто.

В любом случае удивительно то что вместо индексации тех же геномных данных китайцы пошли по этому пути.

Ссылки:
[1] https://www.scidb.cn

#opendata #china #datasets #datacatalogs
5