Ivan Begtin
9.01K subscribers
2.56K photos
5 videos
114 files
5.35K links
I write about Open Data, Data Engineering, Government, Privacy, Digital Preservation and etc.

CTO&Founder of Dateno https://dateno.io

Telegram @ibegtin
Facebook - https://facebook.com/ibegtin
Email ivan@begtin.tech

Ads/promotion agent: @k0shk
Download Telegram
Я довольно много писал про разные форматы файлов в дата инженерии и не только, с одной стороны это кажется очень внутренне-технической темой, неочевидной для тех кто не работает с данными постоянно, с другой стороны в обзоре от Andy Pavlov про СУБД за 2025 год активная конкуренция форматов явно упоминается. Потому что (внезапно!) оказалось что то как ты хранишь данные и то как хранят данные кто-то ещё и которые тебе необходимо использовать может быть как очень удобно и практично, так и создавать ничем не обоснованные дополнительные издержки.

Я привожу в пример как часто на порталах открытых данных публикуют CSV или XML файлы внутри ZIP архивов в формате: один файл - один архив. Но данные/файлы внутри ZIP архивов не приспособлены (без шаманства) для потоковой обработки. Их надо вначале распаковать куда-то как временные файлы, а потом уже обрабатывать и временные файлы удалять. Если файлы небольшие то и ладно, а если это десятки и сотни гигабайт и таких задач много, то возникает вопрос: А отчего же так? Это решается распространением датасетов не в виде ZIP архивов, а сжатием из GZip, LZMA, Zstandard, LZ4 и тд., способами и форматами сжатых данных изначально приспособленных под потоковую обработку. Собственно под такие форматы я делал iterabledata, библиотеку для Python. Она про то чтобы условно любой файл с таблицами или объектами можно было бы перебирать как это принято в Python в csv.DictReader. Последовательный перебор с возвращанием каждой записи как словаря (dict).

Но это лишь один уровень оптимизации, далее вопрос в выборочной обработке данных. Почему в какой-то момент так выстрелил довольно старый формат Parquet? Помимо хорошей компресии и возможности быстрого чтения данных он ещё и дает возможность выборочного чтения и фильтрации данных. К примеру, в отношении XML файлов это уже не работает, в отношении JSON, с большими ограничениями (для JSONl да, в остальных случаях нет) и так далее. А ещё есть огромное число форматов имеющих предметное и отраслевое применение где всё что можно - это, либо считывать их в память целиком, или перебирать содержание по каждой записи.

Вот примеры таких форматов: WARC (файлы веб архивов), PCAP (файлы перехвата сетевого трафика), SAS (файлы статпакета SAS), и еще много что: BSON, KML, GML, XLS, ODS и так далее. Реально огромное число форматов не поддаются фильтрации без загрузки в память или не через фильтрацию при тотальном переборе.

Поэтому когда доходит до их обработки, приходится преобразовывать их полностью или частично в parquet. К примеру, для WARC файлов я всегда их преобразую в один или несколько parquet файлов с метаданными, а оригинальные файлы рассматриваю как контейнеры для контента. И это я не сам придумал, а подсмотрел когда-то у Common Crawl, они поступают аналогично поскольку без этой процедуры собирать статистику сложно, надо перелопачивать каждый WARC файл, а это гигабайты-терабайты-петабайты.

Однако и сам формат Parquet'а неидеален и об этом регулярно пишут в разных местах и появляются такие форматы как Lance, Vortex, Nimble, Vortex, FastLanes и другие. Пока они довольно редки в открытом доступе, но постепенно проявляются. Впрочем parquet оказался достаточно эффективным чтобы эта замена длилась ещё какое-то количество леь

А вот чтобы я бы предсказал так то что грядет тренд на parquet'изацию данных, когда просто сильно удобнее распространять их в структурированном подобным образом виде. Возможно через рассмотрения parquet файлов как контейнеры, а возможно как файлы-сателлиты с метаданным к файлам контейнерам. К примеру, можно вполне заменить VCF файлы (генетика) на Parquet или файлы LDIF (директории пользователей LDAP) на Parquet или файлы KML и GML (геоданные) и тд.

#thoughts #data #dataengineering #fileformats
👍61
В качестве регулярных напоминаний, большое количество открытого кода который я лично создавал и поддерживаю:
- iterabledata библиотека для Python по работе с любыми файлами с записями с помощью прямого их перебора и возвращением каждой записи как словаря (dict). Фактически реализация интерфейсов csv.DictReader и csv.DictWriter для десятков форматов файлов таких как JSON, JSON lines, XML, Parquet, ORC и множества более специфических и отраслевых таких как PCAP, WARC и др.
- internacia-db референсная база данных с базовыми данными по странам и по страновым блокам. Распространяется в форматах JSONL, Parquet, DuckDB, YAML. Полезно для задач обогащения данных, поиска и фильтрации результатов в территориальной привязке, сравнении стран и территориальных блоков.
- undatum это инструмент командной строки для работы с файлами со сложной иерархией так как работают с CSV файлами. Он умеет считать статистику, преобразовывать файлы, анализировать их, разрезать на части и тд. Внутри используется библиотека iterabledata и большое число форматов файлов поддерживаются
- metacrafter библиотека для Python и инструмент командной строки для работы с семантическими типами данных, используется для выявления персональных идентификаторов и иных объектов (кодов организаций, кадастровых и почтовых кодов и так далее)

А также много другого открытого кода о котором я регулярно тут пишу.

#opensource #data #dataengineering #datatools
👍15