乌鸦观察
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——地狱乌鸦
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#中情局 #CIA #塔利班 #本拉登 #疫苗 #疫苗接种 #小儿麻痹 #DNA测序

【抵制疫苗:因中情局对注射乙肝疫苗的儿童的DNA进行秘密测序以逮捕本拉登】
Vaccinations plummeted after CIA’s hunt for Osama bin Laden in Pakistan

为了逮捕本拉登,美国中情局对注射乙肝疫苗的儿童的DNA进行了秘密测序。在这一秘密行动的细节被披露后,该地区所有疾病的疫苗接种率急剧下降,全球根除小儿麻痹症的努力受到了重大打击。

2010年,中情局得到线报,当时的世界头号通缉犯本-拉登就在巴基斯坦。他们确定本拉登亲属的方式是通过疫苗接种计划,利用当地医生给儿童注射乙型肝炎疫苗--然后秘密地对那些被注射者的DNA进行测序。

在这一秘密行动的细节被披露后的一年里,该国那些最支持伊斯兰极端主义的地区的疫苗接种率下降了约三分之一。

西班牙货币和金融研究中心的莫妮卡-马丁内斯-布拉沃说:"它改变了游戏规则,突然间,它让塔利班试图散布的谣言有了很大的可信度,暗示卫生工作者不值得信任。"(泰晤士报)
#基因测序 #DNA #全基因组测序

【国际科学团队完成人类最完整的基因组序列】

国际科研团队“端粒到端粒联盟” 在3月31日正式公布了首个完整、无间隙的人类基因组序列。补全先前相关研究缺失部分,‌有助科学家进一步解开人类生命密码。人类基因组含有约30亿个DNA(脱氧核糖核酸)碱基对,‌完成这些碱基对的完整、无间隙测序对于了解人类基因组变异全谱、掌握基因对某些疾病的影响至关重要。

2001年,‌由包括中国在内的6国科学家共同参与的国际“人类基因组计划”,‌在英国《自然》杂志上发布了人类基因组草图及初步分析。由于当时的测序技术所限,‌这份人类基因组草图中留有许多空白。之后在2003年,‌发布人类基因组图谱。然而,‌这份图谱只完成人类92%的基因组测序,‌剩下8%因为含有重复DNA片段,‌难以测序。10年来,‌随着基因测序技术提高,‌研究人员得以对最后8%测序,‌绘制出人类基因组完整图谱。

为补全人类基因组图谱缺失的8%,‌研究人员为人体染色体和基因基本化学结构约2亿碱基对测序。最后的完整图谱包括逾30亿碱基对序列和近2万个蛋白质编码基因。这些基因中,‌有约2000个基因为这次研究新发现。研究人员还新发现了200万个基因变异,‌其中622处存在于与医学相关的基因中。

当时使用的测序方法是“短读长测序”技术,‌一次只能读取很短的一段基因序列。打个比方,‌如果把基因组的一部分想象成段落中的一句话,‌比如“今天早上小明吃了个包子”,‌通过短读长测序,‌研究者能得到很多简短的小部件,‌比如“今天”、“小明”、“明吃”、“包子”;再经过“拼图”式的分析,‌他们就可以拼凑出这句完整的话,‌但却不知道这句话在整个段落里是否重复出现、重复了多少次。正因缺少这些信息,‌在过去的20年里,‌重复序列一直是基因组学研究的一大难题。

直到两种属于“长读长测序”的新技术诞生,‌人类基因组学的研究才迎来了转折点。这两种技术一种是牛津纳米孔测序,‌它可以一次读取多达100万个DNA碱基,‌准确度中等;另一种是PacBio HiFi测序,‌一次只能读取2万个碱基,‌但准确度近乎完美。通过这两种技术,‌研究者可以直接看到一整个句子甚至段落,‌也就能知道某个序列连续重复了多少次。

从2019年初开始,‌科学家们将这两种新技术结合起来,‌致力于攻克这些重复序列,‌填补缺失的空白。2020年底,‌他们公布了阶段性成果——X染色体和8号染色体的完整组装。现在,‌他们终于揭开了真正完整的人类基因组序列,‌从端粒到端粒,‌包含了每一条染色体。

参与此次研究的一位科学家大卫·豪斯勒说:“现在我们可以站在山顶,‌俯瞰下面的所有景色,‌看到我们人类全部的基因遗产。”

美国国家人类基因组研究所所长埃里克·格林表示,‌完成完整的人类基因组测序是一项重要科学成就,‌为了解人类DNA提供了首个全面视角。这些最基本的信息将增进对人类基因组所有细微功能差别的了解,‌促进对人类疾病的基因研究。(澎湃新闻)(果壳 @微博)(新华社)