Когда MPI заболел
https://software.intel.com/en-us/node/561777

На днях мне довелось собирать кластер из "того, что было" на коленке: без планировщика, без серверной операционки, без #Infiniband. Так вот, во время отладки работы #Intel #MPI я наткнулся на очень интересную статью на портале поддержки Intel: "Examples of MPI Failures". В статье разобраны 7 ситуаций, когда Intel MPI не MPI и как его починить. #HPC на коленке заработало

25 лет технологии MPI


Message Passing Interface (aka #MPI) - промышленный стандарт создания вычислительного ПО, работающего на системах с распределенной памятью отпраздновал четверть века. Статья по ссылке рассказывает о становлении этого стандарта в мире #HPC.

OpenSBLI
https://opensbli.github.io/

Сегодня в меню у нас #python фреймворк разработанный для моделирования процесса взаимодействия скачка уплотнения с пограничным слоем (#SBLI, Shock-Boundary Layer Interactions) в рамках решения уравнения Навье-Стокса с учетом сжимаемости течения. Фреймворк генерирует на выходе код на языке Си, который уже выполняет расчеты. При этом, получаемый код может быть оптимизирован для исполнения на #GPU с #CUDA или #OpenCL, а также он знает про технологии #MPI и #OpenMP.

Гремучая смесь для тех, кто знает, что делает.

https://www.youtube.com/watch?v=Ob4NKZgUK3U

#CFD #HPC #OpenSource

Python FEM и многодисциплинарные расчеты в FEniCS и FEATool
https://www.featool.com/tutorial/2017/06/16/Python-FEM-and-Multiphysics-Simulations-with-Fenics-and-FEATool.html

#FEATool, который позволяет решать задачи методом конечных элементов (#МКЭ) на базе #Matlab, начали взаимодействовать с проектом #FEniCS, который также занимается решением задач в МКЭ припомни #Python и C++. Теперь FEniCS дочтен прямо в GUI FEATool.

Говорят, что FEniCS протестирован для работы со СЛАУ размерности 100 миллионов уравнений, а также может работать на 512 CPUs, используя как #MPI, так и #OpenMP. А это существенно больше того, что сейчас может решать FEATool.

Отказоустойчивый решатель
http://www.nektar.info

Одной из проблем очень больших вычислительных систем являются из постоянные сбои. По статистике, у суперкомпьютеров из TOP 10 кажды день только по физическим причинам выходит из строя хотя бы один вычислительных узел. То уж говорить про системы, о которых мечтают ученые, когда говорят про #Exascale. Решатели, которые будут работать на них, должны обладать способностью эффективно обрабатывать падения части #MPI процессов без остановки расчета.

Команда #ExaFLOW в рамках проекта #Nektar++ (http://www.nektar.info) смогла реализовать расширение для MPI, позволяющее в реальном времени эффективно обрабатывать такие сбои. Расширение носит имя User-Level Failure Mitigation (#ULFM).

#CFD

Расчеты в LS-DYNA на кластерах Windows HPC Cluster


DYNAmore выпустили инструкцию по настройке и работе распределённого решетеля LS-DYNA на кластерах под управлением MS Windows HPC Pack 2016. Инструкция полезная, но на самом деле вам достаточно знать следующий набор команд:



SET LSTC_MEMORY=auto
job submit /jobname: /numcores: /workdir: mpiexec -np i= jobid=



Ну а если вы используете лицензии ANSYS LS-DYNA, то в начало надо добавить еще такое:



set LSTC_LICENSE=ANSYS
set ANSYSLMD_LICENSE_FILE=1055@
set ANSYSLI_SERVERS=2325@



Исходный документ тут: https://project.dynamore.se/public/windowscluster12

#HPC #LS_DYNA #MPI #Windows

https://wp.me/p9vWYY-2yI

by Юрий Новожилов

LS-DYNA HPC
#HPC #LS_DYNA #LSTC #MPI #MPP
by GlukRazor