شش قسمت از سری دگرگشت (تکامل) چیست، تدریس شده توسط خان آکادمی.

@PhilosophyCafe ♨️

تکامل چیست؟
نویسنده: ارنست مایر

ساعت ساز نابینا
نویسنده: ریچارد داوکینز

ایده خطرناک داروین : فرگشت و معنای زندگی
نویسنده: دنیل دنت

داروین، خدا و معنای زندگی
نویسنده: استیو استورات-ویلیامز

کتاب زیست شناسی اجتماعی نوشته ادوارد ویلسون

بهترین کتابی که در زمینه تکامل می توان یافت. این کتاب به فارسی هم ترجمه شده و در ادامه متن اصلی آن هم قرار داده خواهد شد.مشخصات کتاب:
عنوان: تکاملکتاب تکامل مارک ریدلی
نویسنده: مایکل ریدلی
ترجمه: عبدالحسین وهاب‌زاده
ناشر: جهاد دانشگاهی مشهد
سال چاپ: ۱۳۹۱
تعداد صفحه: ۶۵۴
کتاب تکامل مارک ریدلی به‏ صورت بهترین کتاب درسی تکامل درآمده است. این کتاب خواندنی و جذاب و در عین حال متوازن و عمیق، داستان تکامل را از تاریخچه ‎ی مطالعات تا جدید‌ترین تحولات نظریه ‎ی تکاملی بازمی‎ گوید.
سومین ویرایش این کتاب موفق درسی در برگیرنده ‎ی اطلاعات به ‎روز و وسیعا گسترش ‎یافته ‎ایست. قسمت‎‌های مربوط به‎ سازگاری و تنوع، تجدید سازمان‏ شده تا فهم آنرا روشن‏‌تر و سیال ‏‌تر سازد و قسمت‏‌های کاملا به‏ روزش در مورد تکامل جنسیت و اضافه ‏شدن مثال ‏هایی در مورد گیاهان همگی به‏ شکل‏ گیری این ویرایش جدید کمک کرده‏‌اند.
کتاب تکامل نمایانگر یک نگاه قوی و متوازن به ژنتیک جمعیت است و ارایه‎ ی مثال‎‌های فراوان کاربردی از گیاهان و جانوران، این ویرایش اخیر را بس جذاب‎‌تر و دست‎یافتنی ‎‌تر می‌‎ کند.
زیست‌شناسی تکا‌ملی یک علم بالنده است. فهرست موضوع‌های متنوع آن به‌گونه‌ای هول‌انگیز می‌نماید. امروزه زیست‌شناسان تکاملی در رشته‌های چندی از علوم به‎پژوهش مشغولند که برخی از آن‌ها همچون ژنتیک ملکولی جوان است و شتابان در‌حال‌گسترش و بعضی دیگر چون ریخت‌شناسی و جنین‌شناسی است که یافته‌های خود را با تأمل بیشتر و در طی روندی طولانی گرد‌آورده‌اند. زیست‌شناسان تکاملی با مواد گوناگونی کار می‌کنند که از مادهٔ شیمیا‌یی سا‌ده و عریان در لولهٔ آزمایش تا رفتار حیوانات در جنگل و فسیل‌های گرد‌آوری‌شده از سنگ‌ها و صخره‌های لخت و بی‌آب‌و‌علف متغیر است.
با این‌وصف ایدهٔ زیبا، و به‌سادگی قابل‌فهم تکامل ازطریق انتخاب طبیعی را می‌توان در همهٔ این عرصه‌ها به‌شیوهٔ علمی آزمود. این یکی از نیرومند‌ترین ایده‌های عرصهٔ تمامی علم و تنها نظریه‌ا‌ی‌است که می‌تواند به‌جد مدعی یکپارچه‌نمودن زیست‌شناسی باشد.
این علم توان آن‌را دارد که به‏‌واقعیت‌های متنوعی، از آنچه در یک قطرهٔ با‌ران می‌گذرد تا پدیده‌های زیبا و رنگارنگ موجود در یک باغ گیاه‌شناسی و گله‌های غرنده و شتابان شکارهای بزرگ معنا بخشد. از این نظریه می‌توان در درک موضوع‌هایی نظیر خصوصیات زمین ـ شیمیایی سرچشمه‌ی حیات تا نسبت‌های گازی هواسپهر کنونی زمین سود جست. همان‌طور‌که تئودیوس دابژانسکی، یکی از برجسته‌ترین زیست‌شناسان تکاملی قرن بیستم گفته، کلامی که به‌وسعت نقل‌قول می‌شود و اغراقی نیز در آن نیست، «هیچ‌چیز در زیست‌شناسی نیست که خارج از پرتو تکامل مفهومی داشته‌باشد». https://telegram.me/PhilosophyCafe
فهرست مطالب
پیشگفتار نویسنده
پیشگفتار مترجم
بخش ۱: مقدمه
۱. طلوع زیست‌شناسی تکاملی
تکامل یعنی تغییر موجودات زنده از طریق نسب همراه با تغییر
موجودات زنده از خود سازگاری نشان می‌دهند
پیشینه کوتاهی از زیست‌شناسی تکاملی
تکامل پیش از داروین
چارلز داروین
پذیرش داروین
تلفیق نوین
۲. ژنتیک ملکولی و مندلی
توارث از طریق مولکولهای DNA است که از والدین به فرزندان می‌رسند
اطلاعات مورد استفاده در ساختار پروتئین‌های بدن توسط DNA رمزگذاری می‌شود
اطلاعات موجود در DNA از طریق ترجمه و نسخه برداری رمز گشایی می‌شوند
در یعضی از گونه‌ها مقدار زیادی DNA ی غیرکدکننده موجود است
در طی نسخه برداری DNA ممکن است خطاهای موتاسیونی صورت بگیرد
نرخ به روز موتاسیون‌ها را می‌توان اندازه گرفت
موجودات دیپلوئید ازهرژن دوسری به ارث می‌برند
ژن‌ها بر اسا نسبت‌های مشخص مندلی به ارث می‌رسند
چنانچه سازو کار توارثی به صورت غیرمندلی و آمیخته می‌بود نظریه داروین احتمالا صدق نمی‌کرد
۳. شواهد تکامل
در مورد تاریخ حیات سه نظریه احتمالی را می‌شناسیم
تکامل در مقیاس کوچک را می‌توان در عمل مشاهده کرد
تکامل را به صورت تجربی نیز می‌توان ایجاد کرد
درهم آمیزی و شباهت‌های فتوتیپی دو مفهوم از گونه را مطرح می‌کنند
گونه‌های حلقه نشان می‌دهند که تغییرات درون یک گونه ممکن است ت آن حد وسیع باشد که گونه تازه‌ای به وجود اورد
گونه‌های تولید مثلی جدید را به طور تجربی نیز می‌توان ایجاد کرد
مشاهدات کوچک -مقیاس را می‌توان برای موارد درازمدت بسط داد
گروههای موجودات زنده مشابهت‌های همساخت دارند
همساختی‌های مختلف با یکدیگر همبستگی دارند و می‌توان آن‌ها را به صورت سلسله مراتبی طبقه بندی کرد
شواهد فسیلی برای تغییر و تبدیل گونه‌ها موجود است
ترتیب ظهور گروه‌های عمده در مدارک فسیلی حاکی از روابط تکاملی بین آنهاست
خلاصه‌ای از شواهد تائیدکننده تکامل
خلقت باوری هیچ توجیهی برای سازگاری ندارد
خلقت باوری علمی جدید به لحاظ علمی قابل دفاع نیست

۴. انتخاب طبیعی و تغییرات
تنازع بقا در طبیعت جریان دارد
انتخاب طبیعی، مشروط به شرایط به خصوص، در حال عمل است
انتخاب طبیعی هم توجیه گر تکامل است و هم توجیه گر سازگاری
انتخاب طبیعی ممکن است جهت دار، تثبیت گر یا آشوبگر باشد
تغییرات در جمعیت‌های طبیعی گسترده است
افراد جمعیت از نظر موفقیت تولید مثلی تغییرات نشان می‌دهند
موتاسیون و نوترکیبی موجب تغییرات تازه می‌شوند
تغییرات حاصل از نوترکیبی و موتاسیون نسبت به سمت و سوی سازگاری تصادفی‌اند
بخش۲: ژنتیک تکاملی
۵. تئوری انتخاب طبیعی
ژنتیک جمعیت به ژنوتیپ و بسامد ژنی توجه دارد
یک مدل اولیه از ژنتیک جمعیت دارای چهار مرحله اصلی است
چنانچه انتخاب در بین نباشد بسامدهای ژنوتیپی در معادلهٔ هاردی-واینبرگ قرار می‌گیرند
با یک مشاهده ساده می‌توان دید که آیا ژنوتیپ‌های یک جمعیت در تعادل هاردی-واینبرگ هست یا نه
معادله هاردی-واینبرگ به لحاظ مفهومی، تاریخی و در پژوهش‌های علمی و همچنین در کارکرد مدلهای نظری اهمیت دارد
ساده‌ترین مدل انتخاب مربوط به یک آلل برگزیده در یک لوکوس است
مدل انتخاب را در مورد شب پره‌های فلفلی می‌توان به کار برد
مقاومت حشره‌ها به آفت زدا‌ها مثالی از انتخاب طبیعی است
شایستگی‌ها ارقام مهمی در نظریه تکامل‌اند و آن‌ها را به سه روش اصلی می‌توان محاسبه کرد
انتخاب طبیعی که روی یک آلل مطلوب در یک لوکوس واحد عمل می‌کند به عنوان مدل عمومی تکامل به حساب نمی‌آید
یک موتاسیون نامطلوب واژگردان به بسامد تعادلی قابل محاسبه‌ای تکامل می‌یابد
امتیاز ناجور تخمی
شایستگی یک ژنوتیپ ممکن است به باروری آن وابسته باشد
جمعیت‌هایی با تقسیمات فرعی نیازمند اصول ژنتیک جمعیت متفاوتی هستند
۶. رویدادهای تصادفی در ژنتیک جمعیت
بسامد آلل‌ها در یک فرایند تصادفی به نام رانش ژنتیکی در طی زمان تغییر می‌کند.
رانش تصادفی می‌تواند یک ژن را جایگزین دیگری کند
تعادل‌های هاردی-واینبرگ برفرض نبودن رانش ژنتیکی استوار است
رانش خنثی به مرور زمان قطاری از جورتخم‌ها را به بار می‌آورد
در اثر وجود موتاسیون‌های خنثی همواره مقدار معینی از چندریختی در جمعیت وجود دارد
اندازه جمعیت و اندازه جمعیت موثر
۷. انتخاب طبیعی و رانش تصادفی در تکامل ملکولی
رانش تصادفی و انتخاب طبیعی هر دو به لحاظ نظری می‌توانند تکامل ملکولی را توصیف کنند
نرخ تکامل ملکولی و مقدار جورهای ژنتیکی را می‌توان اندازه گرفت
بدون تردید نرخ تکامل ملکولی ثابت‌تر از آن است که تحت کنترل انتخاب طبیعی دانشته شود
ساعت ملکولی نوعی تاثیر زمان نسل از خود بروز می‌دهد
تئوری تقریبا خنثی
نرخ تکامل و محدودیت کنشی
نتیجه گیری و تذکر: تغییر گفتمان خنثی باوری
توالی ژنومیک به یافتن راههای جدیدی در مطالعه تکامل ملکولی منجر شده است
نتیجه گیری: ۳۵ سال پژوهش در تکامل ملکولی
۸. ژنتیک جمعیت دو لوکوسی و چند لوکوسی
تقلید در پروانهٔ PAPILIO با بیش از یک لوکوس کنترل می‌شود
ژنتیک دو لوکوسه با بسامدهای هاپلوتیپ سروکار دارد
بسامدهای هاپلوتیپ‌ها ممکن‌است در تعادل پیوستگی باشند یا نباشند
ژن‌های HLA انسان یک سیستم ژنی چند لوکوسه‌اند
عدم تعادل پیوستگی به‌دلایل چندی ممکن‌است وجود داشته باشد
مدل‌های دولوکوسه از انتخاب طبیعی را می‌توان ارائه کرد
در مدل‌های دولوکوسه مفت‌سواری روی می‌دهد
روفتن انتخابی می‌تواند شواهدی از انتخاب در توالی DNA فراهم کند
عدم تعادل پیوستگی ممکن‌است مفید‌‌، خنثی یا زیانبار باشد
رایت مفهوم تأثیرگذار توپوگرافی سازشی را ابداع نمود
تئوری تکاملی تعادل متغیر https://telegram.me/PhilosophyCafe
۹. ژنتیک کمّی
در یکی از سهره‌های داروین تغییرات آب و هوا موجب به‌پیش راندن تکامل اندازهٔ منقار شده است
ژنتیک کمّی با صفاتی سروکار دارد که با شمار زیادی از ژن‌ها کنترل می‌شوند
تغییرات را می‌توان به اثرات ژنتیکی و محیطی تقسیم نمود
واریانس یک صفت به تأثیرهای ژنتیکی و محیطی تقسیم می‌شود
خویشاوندان دارای ژنوتیپ‌های مشابه‌اند و این خود همبستگی بین آن‌ها ایجاد می‌کند
توارث‌پذیری به آن سهم از واریانس فنوتیپی گویند که جمع‌پذیر باشد
توارث‌پذیری یک صفت واکنش آن به انتخاب طبیعی را معیّن می‌کند
روابط بین ژنوتیپ و فنوتیپ ممکن‌است خطی نباشد و لذا واکنش‌های قابل ملاحظه‌ای نسبت به انتخاب به‌وجود آورد
انتخاب تثبیت‌گر موجب کاهش تغییرپذیری یک صفت می‌شود
صفات در جمعیت‌های طبیعی که در معرض انتخاب تثبیت‌گر باشند تغییرات ژنتیکی نشان می‌دهند
سطح تغییرات ژنتیکی جمعیت‌های طبیعی به‌طور کامل معلوم نیست
بخش۳: سازگاری و انتخاب طبیعی
۱۰. توجیه سازگاری
انتخاب طبیعی تنها توجیه شناخته‌شدهٔ ممکن برای سازگاری است
در مطالعهٔ تکامل تکثّرگرایی مناسب است اما نه درمورد سازگاری