polyhedron
2.63K subscribers
1.07K photos
15 videos
108 files
344 links
polyhedron 的自媒體備份。有事請聯繫telegram 的 @ngiamzsjit 或進入我的“半地穴式聊天室”留言(當前鏈接 https://t.me/+m22RQOc_uJdhNjE1
Download Telegram
上面的題選哪個?
Anonymous Quiz
20%
♭B大調
36%
E大調
27%
c小調
17%
G大調
剛理明白,藏文字典的排序是這樣的:
ga (gi gu ge go) gya gra (grwa在gra單音節後、grag前) gla
dga dgya dgra
bga bgya bgra
mga mgya mgra
vga vgya vgra
rga rgya
lga
sga sgya sgra
brga brgya
bsga bsgya bsgra

即按基字 > 前/上加字(先前,再上,再前+上)> 下加字 y r l > 元音 a i u e o > 後加字 > 次後加字 > w下加字
這樣的排序。
一堆藏語 br- < *mr- 的詞在漢語都有和明母相關的同源詞:
སྦྲང་ sbrang “蒼蠅” < /*smraŋ/ : 蠅 jing < /*m-lɯŋ/(參攷 黽 mrengx < /*mreeŋʔ/)
འབྲས་ vbras “米” < /*ɦmras/ : 糲 lied < /*m-ras/ (參攷 邁 mrad < /*mraads/)
བྲེལ་ brel “忙” < /*mrel/ : 繁 byan < /*ban/(也許是*/ʔmral/之類?) (參攷 每 muaix < /*mɯɯʔ/)
འབྲི་ vbri “母牛” < /*ɦmri/ : 犛 mrau < /*mrɯɯ/ 或 li < /*m-rɯ/
འབྲོག vbrog “牧” < /*ɦmrok/ : 牧 miuk < /*mrɯk/
འབྲོང་ vbrong “野牛” < /*ɦmroŋ/ : 牻 mrung < /*mrooŋ/
https://weibo.com/1180557177/IsdHAoqfw
關於說武漢冠狀病毒是非典類似的冠狀病毒加以HIV片段改造的說法,我這裏來給出我的分析。

※太長不看:印度團隊的分析有問題,我並不能看出武漢病毒有人爲改造的痕跡。※

緣起是印度硏究者1月31号發在bioRxiv上的這篇文章«Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag» https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1.full.pdf ,他們比對了SARS和武漢病毒上的一個重要蛋白spike,發現武漢病毒相比SARS多了4個區域的插入序列,各4-6個鹼基這樣(圖1)。然後他們把這4段短序列在所有病毒的序列裏面搜索了一遍,發現這幾段序列的最近匹配都在艾滋病毒HIV上面(圖2)。於是他們猜測武漢冠狀病毒是用某種現實中自然存在的病毒裏面用生物工程辦法加入了這幾段HIV序列改造而成的。

我的分析方法也很簡單,就是看這幾段序列是否爲武漢冠狀病毒所獨有。因爲如果確實是用已有序列加上這幾段HIV序列改造而來的,那麼和武漢病毒和SARS最近的幾種冠狀病毒應該是和SARS一樣,只有武漢病毒多出這幾段。於是我從NEJM這篇文章(https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001017 )裏面選了幾個全基因組序列,提出了其中的spike蛋白序列(我挑選的序列見圖3的箭頭,1是武漢病毒,2是和武漢病毒比較近的蝙蝠冠狀病毒,5是SARS,3和4是和SARS比較近的蝙蝠冠狀病毒),然後做了一下序列比對。(我其實也用再遠一層的蝙蝠病毒KF636752和MERS病毒放一起比對過,但序列差距過大,會干擾武漢病毒和SARS的比較,於是扔掉了。)

結果這四個區域(見圖4-7),第1個區域只有人SARS偏短,其它的差不多;第2個區域武漢病毒和接近的蝙蝠序列很接近;第3個區域武漢病毒、武漢相關蝙蝠病毒、所有類SARS病毒分成3類;第4個區域僅武漢病毒長了,但HIV序列相比武漢病毒的這個區域又插入了好幾個鹼基;甚至還有一個區域(圖8),人武漢病毒和人SARS差不多長,而蝙蝠的都短。也就是說,至少從這幾個區域來說,是不符合【用一個野生病毒加上人爲插入HIV序列改造】這麼一個模式的。

至於印度團隊的錯誤,今天也有很多不同的文章批判過了,國內國外的都有。比如這篇 https://theprepared.com/blog/no-the-2019-ncov-genome-doesnt-actually-seem-engineered-from-hiv/ ,指出印度團隊只搜索了NCBI的病毒數據庫,而搜索的序列因爲都非常短,所以E值並不算顯著。如果放寬搜索範圍到所有生物,則有無數匹配。另外有其它人搜索過,也找到了蝙蝠冠狀病毒的序列,所以可能是印度搜索用的庫收錄不全。
新浪微雹不知道是因爲故意想要搞陰謀論,還是人工智障,把我上面那篇文章屏蔽了。在知乎寫的回答也被審覈中。
又被豬刪了
Paraskevis_D_2020_Full_genome_evolutionary.pdf
1.6 MB
歡迎專業人士討論。